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受 Spotify 启发:用混合搜索和 Rust 提升 Meilisearch

我们如何创建 Arroy,一个基于 Spotify 的 Annoy 的 Rust 库。

2023年12月14日8分钟阅读
Spotify-Inspired: Elevating Meilisearch with Hybrid Search and Rust
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这是系列博客文章的第一部分,最初发布在我的个人博客上

在Meilisearch,我们正在努力进行混合搜索,将广泛使用的关键词搜索算法与不太常见的语义搜索相结合。前者非常擅长精确匹配,而后者则能找到你更能“描述”的东西。

我将解释为什么我们甚至会谈论Meilisearch/arroy,以及为什么它对我们很重要。语义搜索对我们来说是新事物。其原理很简单:文档与向量(浮点数列表)相关联,它们彼此越接近,在语义上就越接近。当用户查询引擎时,您会计算查询的嵌入(向量),并进行近似最近邻搜索,以获取与用户查询最接近的n个项目。有趣的是:这么长时间以来,Annoy仍然是顶级竞争者之一,所以想象一下我们最终发布Arroy时会是怎样。

听起来很简单,对吧?你**真的**认为这个系列博客文章会讨论一个死简单的主题吗?加入我们,与@irevoire和我(@Kerollmops)一起,在@dureuill的协助下,将这个尖端库移植到Rust。

优化高维嵌入的存储和搜索

嵌入的维度在768到1536之间。Meilisearch的客户希望存储超过1亿个嵌入。未经过任何降维算法修改的嵌入使用32位浮点数。这意味着存储这些数据将占用286 GiB到572 GiB之间,具体取决于维度。

是的,它能放入内存,但代价是什么?存储在磁盘上便宜得多。而且!这还只是原始向量。我向你保证,在所有向量中进行O(n)近似最近邻搜索会非常慢。所以我们决定将它们存储在磁盘上。在选择Spotify/Annoy之前,我们研究了许多不同的解决方案。最初,我们使用了一个名为instant-distance Rust crate的HNSW,这是另一种数据结构,用于进行ANNs(近似最近邻)搜索。然而,它不是基于磁盘的;所有数据都存在于内存中,这很不实用。

Spotify的超平面树实现高效的ANNs

Spotify开发了一个很酷的C++库,用于在庞大的向量集中进行搜索。该算法生成多棵树来引用向量。树的节点是随机超平面,将向量子集分成两半。根节点将整个向量集分成两半,左右分支递归地再次分割向量子集,直到子集足够小。当我们执行ANNs搜索时,我们会遍历所有根树,并根据提供的干草堆决定是走向超平面的左侧还是右侧。优点是每个节点和向量都直接存储在内存映射文件中。

Hyperplanes mapped to binary trees

Annoy和Arroy生成超平面以分割向量空间的方式

在树的末端,我们可以看到后代节点。这些节点定义了符合递归分裂节点上方这一侧的叶向量的最终列表。它是一个用户提供的无符号整数列表。Annoy将它们表示为u32的切片,但我们决定使用RoaringBitmaps来减小其大小。Annoy无法压缩它们,因为它们有一个有趣的限制:所有节点、用户叶向量、分裂节点和后代必须具有相同的大小,才能通过磁盘偏移量进行访问。

上图展示了一个分割平面如何表示。一个超平面在这里将节点子集分割成两维,但想象一下,它有768到1536个维度。每个超平面创建两个点子集,这些子集再被另一个超平面递归分割。一旦要分割的点数足够小,我们就会创建一个后代节点,其中包含与这些点对应的项目ID。此外,这些点的嵌入从不在内存中重复;我们通过它们的ID来引用它们。

将Annoy适配到LMDB

那么,如果它运作得如此好,我们为什么必须将它移植到Rust呢?首先,因为我遵循“用Rust重写”的教条😛;其次,因为这是一个有很多骇人听闻的黑客和未定义行为的C++库;第三,因为Meilisearch基于LMDB,一个原子、事务性、内存映射的键值存储。此外,自2015年以来,他们一直想使用LMDB,但尚未实现;这需要大量时间来相应地更改数据结构。

LMDB使用B树来排序条目,它比Annoy占用更多的中间数据结构空间,Annoy直接使用文件中的偏移量来标识向量。使用这种键值存储的另一个优点是管理增量更新。插入和删除向量更容易。如果你在Annoy中插入一个由高32位整数标识的向量,它将分配大量内存来存储它作为专用偏移量,并在必要时增加文件大小。

在 Meilisearch 和 Arroy 中,我们使用 heed,一个类型化的 LMDB Rust 封装器,以避免与 C/C++ 库相关的未定义行为、bug 和其他问题。因此,我们大量使用&mut&,以确保在保持对键值存储条目的引用的同时,我们不会修改它们,并且我们确保读写事务不能在线程之间引用或发送。但这将是另一个故事了。

我们最初认为使用这种键值存储会使 Arroy 比 Annoy 慢。然而,LMDB 在将页面写入磁盘之前会将它们写入内存,这似乎比直接写入可变内存映射区域要快得多。另一方面,LMDB 不保证 Annoy 文件格式所允许的值的内存对齐;我们稍后会讨论这一点。

使用SIMD优化向量处理

Arroy 最耗 CPU 的任务之一是尝试将向量云一分为二。这需要在热循环中计算大量的距离。但是我们从内存映射磁盘读取嵌入。这会出什么问题呢?

fn align_floats(unaligned_bytes: &[u8]) -> Vec<f32> {
    let count = unaligned_bytes.len() / mem::size_of::<f32>();
    let mut floats = vec![f32::NAN; count];
    cast_slice_mut(&mut floats).copy_from_slice(unaligned_bytes);
    floats
}

我们在 macOS 上使用 Instrument 工具分析了程序,发现大量时间都花在了数据移动上,即_platform_memmove。原因是,从磁盘读取未对齐的浮点数会导致未定义行为,因此我们如上所示,将浮点数复制到对齐的内存区域中。代价:每次读取都会进行一次分配,并调用一次memmove

Profiling showing a big memmove usage

分析显示大量内存复制以对齐字节

在将距离函数从 C++ 移植到 Rust 时,我们直接使用了 Qdrant 经过 SIMD 优化的距离函数。尽管我们意识到读取未对齐内存的性能开销,但我们决定在未对齐的浮点数上执行距离函数,确保不将其表示为&[f32],因为那将是未定义行为。这些函数接受原始字节切片,并使用指针和 SIMD 函数处理它们。我们释放了性能。距离函数虽然变慢了,但它弥补了memmove和分配的开销!

Profiling showing no memmove usage

直接处理未对齐内存消除了复制

memmove调用类似,我们可以看到_platform_memcmp函数在这里占据了大量空间。原因是LMDB使用这个标准函数来比较键字节,并决定一个键在树中是按字典顺序位于另一个键之上还是之下。每当我们读写LMDB时都会使用它。@irevoire大幅减小了键的大小,并看到了性能的显著提升。我们进一步尝试使用MDB_INTEGERKEY,这使得LMDB使用计算机的字节序进行内存比较,但这使用起来很复杂,并且没有显示出显著的性能提升。

即将面临的挑战

在将这个酷炫的算法移植到Rust和LMDB时,我们缺少一个最重要的功能:树构建的多线程处理。造成这种缺失的主要原因是LMDB不支持并发写入磁盘。这是这个库的魅力之一;写入是确定性的。我们已经非常了解LMDB,我们将在本系列的第二部分解释我们如何利用LMDB的力量以及我们如何击败Spotify库。

除了实现与Annoy现有功能相同的功能外,Meilisearch还需要更多。我们在Arroy中实现了微软的Filtered-DiskANN功能。通过提供我们想要检索的项目ID子集,我们避免了搜索整个树来获取近似最近邻。我们将在即将发布的文章中讨论这一点。

在 Meilisearch v1.6 中,我们优化了仅更新文档部分(例如投票数或浏览量)的性能。Arroy 的上述单线程版本在每次向量调整时都会重新构建树节点。@irevoire 将在他的下一篇文章中探讨 Arroy 的增量索引功能,这是 Annoy 不具备的能力。

您可以在Lobste.rsHacker NewsRust SubredditX(原Twitter)上评论此文章。

本系列的第二部分第三部分现已发布,进一步探讨了Rust中ANN算法的进步。


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